Die Fondsmittel werden für Beiträge an gemeinnützige, wohltätige, kulturelle und andere im öffentlichen Interesse oder im Interesse der Stadt Zürich liegende Zwecke verwendet. Es können einmalige, besondere Vorhaben unterstützt werden. 

Wiederkehrende oder regelmässig stattfindende Tätigkeiten, Aktionen oder Veranstaltungen (Ausnahme Jubiläen) werden nicht unterstützt. Ausserdem werden keine Beiträge gesprochen, wenn für dasselbe Projekt städtische Subventionen ausgerichtet werden oder ein konkreter Objektkredit bewilligt wurde.

Die Mittel werden für Projekte zur Verschönerung der Stadt Zürich und zur Vermehrung der Grünflächen in der Stadt Zürich verwendet. Es können besondere Investitionen oder Anschaffungen für die Verschönerung getätigt werden. Auch werden einmalige und ausserordentliche Beiträge an gemeinnützige Institutionen in der Stadt Zürich gewährt.

Es werden keine Beiträge gesprochen, wenn für das selbe Vorhaben oder Projekt bereits städtische Subventionen ausgerichtet werden oder ein konkreter Objektkredit bewilligt wurde. Zudem werden in der Regel keine Betriebsbeiträge oder jährlich wiederkehrende, regelmässige Beiträge ausgerichtet.

Der Klöti-Waser-Fonds ist 2011 aus dem «Waserschen Fonds für die Verschönerung der Stadt» und dem «Dr. Emil Klöti-Fonds» hervorgegangen.