Das Stadtspital Zürich pflegt zahlreiche Kooperationen nach innen und aussen. Intern kooperieren zahlreiche Spezialgebiete fächerübergreifend (Experten-Boards, interdisziplinäre Sprechstunden). Nach aussen arbeitet das Stadtspital Zürich vernetzt mit Partnerspitälern, nachsorgenden Institutionen und der niedergelassenen Ärzteschaft zusammen.